AMICRON-FAKTURA ist in folgenden Versionen erhältlich: (Änderungen vorbehalten)
Professional-Version
Dies ist die leistungsfähigste Version, die alle verfügbaren Leistungsmerkmale beinhaltet und optional auch als netzwerkfähige Version erhältlich ist. Alle verfügbaren Schnittstellen (Fibu/DATEV, Banking, AMICRON-MAILOFFICE 5, Auftragsimport, Shop-Schnittstelle etc.) sind enthalten.
Die Professional-Version enthält auch die folgenden Funktionen, die bei der Standard-Version nicht enthalten sind:
•integrierte Seriennummernverwaltung
•Auftragsexport ASCII, XML, OpenTrans, Edi4All (ermöglicht z. B. auch eine optionale Edi-Konvertierung)
•Versandschnittstelle DHL, DPD 
•Bestandsübersicht Lager <> Artikel
•Artikelabgleich mit Onlineshop
•Import von Aufträgen, die als E-Mail-Anlagen verschickt wurden (setzt AMICRON-MAILOFFICE 5 voraus)
Standard-Version
Entspricht der Professional-Version, enthält jedoch nicht die bei der Professional-Version zusätzlich integrierten Funktionen (siehe obige Liste).
Fibu-Modul
Die integrierte Finanzbuchhaltung ist für die Standard- und Professional-Version optional verfügbar. Eine Schnittstelle zur Euro-Fibu und zur DATEV ist sowohl bei der Standard- als auch bei der Professional-Version ohne Aufpreis enthalten.
Prüfversion
Diese Version ist kostenlos erhältlich und dient dazu, AMICRON-FAKTURA vor dem Kauf der Standard- oder Professional-Version ausführlich testen zu können.
•kann maximal 30 Arbeitstage lang genutzt werden
•Datenkapazität ist begrenzt
•Netzwerkeinsatz zu Testzwecken auf maximal zwei Arbeitsstationen möglich
Ein Aufstieg auf eine höherwertige Version oder eine netzwerkfähige Version ist möglich. Vorhandene Daten und Formulare können dabei übernommen werden.
Eine Datenübernahme aus älteren Versionen ist bei allen Versionen möglich.